Dosarul “Flota” în care este inculpat şi şeful statului, Traian Băsescu, se află pe masa procurorilor anticorupţie din 5 decembrie 2005, cînd completul de nouă judecători al Înaltei Curţi de Casaţie şi Justiţie a decis restituirea dosarului la DNA, întrucât rechizitoriul nu a fost semnat de şeful instituţiei, ci de adjunctul acestuia, ceea ce contravine Codului de procedură penală. Direcţia Naţională Anticorupţie a infirmat soluţia dată de procurorii care au decis trimiterea în judecată a lui Băsescu, alături de alte 79 de persoane şi a reluat cercetările în dosar. Astfel, s-a dispus efectuarea unei noi expertize financiar-contabile, pentru stabilirea prejudiciului creat statului, cel din rechizitoriu fiind considerat nereal. Potrivit şefului DNA Bucureşti, procuror Daniel Morar, partea din dosar referitoare la preşedintele Traian Băsescu, inculpat pentru fapte comise în perioada în care era ministru al Transporturilor şi nu şef al statului a fost disjunsă cercetarea este continuată în alt dosar. Rezultatul noilor expertize tehnice şi financiar–contabile, prin care s-a cerut recalcularea prejudiciului, ar putea veni în luna martie a acestui an.

Dosarul "Flota" a avut ca obiect stabilirea modului în care flota românească a pierdut mai multe nave maritime de mare capacitate, prin infracţiuni săvârşite de cei care ar fi iniţiat şi derulat fraudulos asocierea CNM Petromin SA Constanţa cu grupul de firme private Torvald Klaveness Oslo din Norvegia, în perioada aprilie 1991 - august 2000. Procurorii Parchetului Naţional Anticorupţie, actuala DNA, au stabilit că cei 80 de inculpaţi ar fi păgubit statul român cu peste 11.000 de miliarde de lei, echivalentul a 275 de milioane de euro, prin înstrăinarea a 16 nave.Dosarul cauzei este format din 192 de volume, care au în total peste 48 de mii de file. Rechizitoriul are, la rândul său, 461 de pagini. Iniţial, în dosarul “Flota” au fost cercetate 136 de persoane, 80 fiind deferite justiţiei, pe 10 august 2004, iar pentru altele 51 procurorii au hotărît disjungerea. Printre inculpaţii trimişi în judecată pentru comiterea unor fapte penale se numără foştii miniştri ai Transporturilor Traian Băsescu, Paul Teodoru şi Aurel Novac, foştii secretari de stat Călin Dragomir Marinescu, Gheorghe Adrian Marinescu şi Viorel Oancea dar şi actualul prefect al Constanţei, Dănuţ Culeţu.