În cazul în care, în completarea Declaraţiei 394, unul sau mai multe coduri de înregistrare în scopuri de TVA ale partenerilor de tranzacţii, introduse în declaraţie, nu sînt acceptate de programul de asistenţă (la momentul introducerii sau, în cazul utilizării unei aplicaţii informatice distincte, la momentul verificării fişierului în programul de asistenţă), contribuabili vor completa o Anexă la declaraţie. În anexă vor fi trecute o serie de informaţii, printre care se numără datele de identificare ale contribuabilului care completează declaraţia şi ale reprezentantului fiscal, dacă este cazul (codul de înregistrare în scopuri de TVA, denumire, adresa domiciliului fiscal), datele de identificare ale contribuabilului căruia îi aparţine codul de înregistrare în scopuri de TVA respins de programul de asistenţă (codul de înregistrare în scopuri de TVA, denumire, adresă).

De asemenea, se vor trece numărul de înregistrare şi data emiterii facturii/facturilor primite de la/emise către contribuabilul menţionat anterior, baza impozabilă şi TVA-ul aferent înscrise pe factură/facturile menţionate la pct. C, precum şi numele, prenumele, funcţia şi semnătura persoanei care completează declaraţia. La primirea unei declaraţii însoţite de o astfel de anexă, organul fiscal va transmite copia anexei, în 48 de ore de la data primirii, către Direcţia generală a finanţelor publice de care aparţine. Direcţia Generală a Finanţelor Publice va transmite Anexa primită la Activitatea de Inspecţie Fiscală - Serviciul coordonare, programare, analiză şi îndrumare pentru activitatea de inspecţie fiscală, care va avea în vedere includerea în programul de activitate în vederea efectuării unui control inopinat la contribuabilul/contribuabilii menţionaţi în Anexă ca avînd codul de înregistare în scopuri de TVA respins de programul de asistenţă.